馬祖列島屬於島嶼地形，包括無人島礁在內共三十餘座島嶼，生態資源非常豐富，而受到環境因子高度複雜的影響，島嶼本身的脆弱性也相對較高。因此，維護軟硬體資源推動永續發展，是近幾年從中央到地方的高度共識。而在追求永續發展的同時，如何在經濟、環境、社會之間取得平衡，對地方未來發展是重要的挑戰與關鍵，必須朝以下幾個方向進行。

　首先從環境保育觀點來看，馬祖擁有豐富的自然資源與珍貴物種，如黑嘴端鳳頭燕鷗、紅花石蒜、藍眼淚及許多原生物種，連江縣政府在多年前即著手推動各項保育政策，包括成立野生動物保護區，藍眼淚生態研究，委托台中科博館進行海豚生態研究等。因此，發展生態旅遊應該是政府與民間共同努力目標，如此不僅可以落實環境保育，更增加地方觀光旅遊的資源，在保育與發展觀光之間取得平衡，目前成果較顯著者，非藍眼淚莫屬，未來海上賞鷗及路上生態導覽等，都還有發展空間。

　其次則是推動文化資產保存與活化利用，也是發展永續的重點工作，馬祖從三十餘年前即著手推動傳統聚落保存，近年縣府文化處更大力推動在地文化活動如媽祖昇天祭、元宵擺暝文化祭、國際藝術島等。此外，利用現有軍事遺址推動戰地轉譯，轉譯再生，不僅從多元面向提升旅遊品質，更符合永續發展目標。

　近二十餘年來，馬祖在觀光人口大幅成長情況下，水電能源與垃圾環保處理等也不斷大量增加，對地方政府形成重大負擔。因此，發展再生能源，推動風力發電、太陽能以期增加自然能源使用，減少廢棄物處理能量，避免對環境造成重大衝擊。在水電管理及災害防治方面，引進智慧基礎建設等，都是推動永續的重要基礎工作。

　最後，盤點現有環境能源如水電能源、垃圾處理，交通、餐飲、住宿能量，估算出總承載量，進行總量管制，否則環境資源無限耗損，對永續必將產生重大影響。

　縣府已成立有永續發展委員會，以落實聯合國SDGS為目標，但SDGS內容項目眾多，如何落實才是關鍵，否則也只是流於形式。因此，不妨針對其內容做篩檢，以符合地方永續發展需要。此外，國內外離島之間也可共同合作，進行永續經驗交流，甚至成立離島永續發展聯盟，借鏡國內外離島推動永續經驗，從中研析其共同性與差異性據以落實。

　結論是，為落實馬祖永續發展，必須從自然保育，能源再生，在地文化，培育人才，建立新的觀光資源，透過全方位規劃與參與，馬祖必然有潛力成為台灣典範的永續離島社區！