每年4月14日（National Dolphin Day）是美國獸醫協會推廣之「世界海豚日」，期望藉由這天提升民眾對海豚的了解與保育知識。臺灣本島東海岸4月份至10月份為賞鯨豚的旺季；而馬祖海域自9月起（秋季）到隔年4月份（春季）的豚況亦不遑多讓，是絕佳的賞海豚季節。鯨豚在海洋裡的生態位置，幾乎等同於陸地上的人類，牠們是最具代表性的海洋動物之一，不只如此，也有不少人認為牠們模樣討喜，是代表海洋的海洋動物明星。

　但是，讓保育人士擔憂的是，帶著微笑海豚其實並沒有看起來那麼開心，牠們面臨過度捕撈、塑膠污染與海中噪音等問題。馬祖四面環海，與海洋有高度依存關係，海洋生態系的永續性至關重要；台中科博館團隊指出，馬祖列島海域鄰近閩江河口，是鹹淡水交會地區，營養鹽豐富，也因此成為海洋生物重要的棲息地，多次目擊紀錄，證明馬祖海域是鄰近海域中露脊鼠海豚最穩定棲息的環境，也突顯馬祖是窄脊及寬脊露脊鼠海豚二物種需要保育的重要地區。

　露脊鼠海豚，是馬祖海域的常客，佔了當地所有海豚紀錄的95%以上。此外，瓶鼻海豚和偽虎鯨也時常現身馬祖周圍的海域。每當秋季至隔年春季適逢東北季風吹拂時期，南竿島西南側離岸距離近且制高點，例如南竿遊客中心附近的官帽山步道、鐵堡或55據點等地，都是欣賞海豚英姿的絕佳地點。近年來，國立科博館團隊不定期舉辦鯨豚陸地觀測活動，邀請鄉親共同關注馬祖鯨豚保育，提升大眾對這種海洋哺乳動物的保育意識。

　鯨豚是海洋哺乳動物，使用肺臟呼吸，潛水一段時間後，必須浮出海面換氣，當我們從事海洋觀察時，水面下的生態不容易在水面上看見，但鯨豚因為需要換氣比較沒有水面隔閡的問題，因此鯨豚被認為是海洋生態的指標生物。這海域若鯨豚頻繁出沒，表示這海域有牠們的食物，意謂這海域海洋食物鏈相對健全。這海域若牠們變少，可能就是這裡的食物鏈狀態出了問題；若這海域鯨豚從原本的頻繁出沒變成絕跡，顯然這裡的海洋生態處於崩潰狀況。鯨豚保育的真義，其實是保護這海域健康的食物鏈狀態，也就是保護這裡的海洋生態。

　鯨豚為高度洄游物種，且具有成熟期晚、生殖數少等特性，受到船隻撞擊、海洋污染、水下噪音、獵捕走私、混獲及漁具纏繞等威脅，我國於1990年代將鯨豚列入保育類野生動物名錄，參考國際評估結果，除了臺灣西部海域的中華白海豚列為極危，其餘有3種列為瀕危、3種列為易危，2種列為近危、3種資訊不足、21種暫列無危。

　雖然保育鯨豚的聲浪興起，但人們對於海洋的探索和利用卻是不減反增，如漁業、探勘、工程、軍事、能源等發展，都持續地影響海洋環境與鯨豚生態。馬祖鯨豚的水域棲地具有保育重要性，在鯨豚保育的工作上，更是要關懷鯨豚生態與海洋環境等各項議題，讓鯨豚保育向下扎根。