防範禽流感入侵，視同全員作戰，海岸巡「晴空專案」就是防治的啟動，除順應民情，執行威力掃蕩大陸漁船越界之外，堵住家畜、肉品等輸進，以防疫情登陸，也是主要任務。為持續維持馬祖零本土病例之發生，有賴全民發揮整體防範措施，尤以動物走私，千萬不要碰觸，以免破壞這塊家園淨土。
為預防緊急疫災及禽流感爆發流行的衝擊，並確保小三通及順暢，進而提昇面對緊急疫災及新興傳染病（如禽流感）整體應變能力，本縣成立「緊急疫災防治動員作戰工作小組」，各相關單位對小組成員有無新增成員及職責，以落實各工作小組依工作權責辦理相關業務，以建立一個嚴密防護網。
根據流感大流行歷史回顧，在一九一八年至一九一九年有二千至四千萬人死亡，一九五六年至一九五七年有超過一百萬人死亡，一九六八年至一九六九年約有七十萬人死亡。
根據世界衛生組織統計，禽流感（H5N）病毒自九十三年一月至九十四年七月，確定病例數一百零八例，死亡病例數五十四例，致死率百分之五十。以侵襲率百分之二十五推估，八週內將造成我國五百三十萬人感染、六萬四千多人住院、一萬三千多人死亡，平均全國一天即有一千一百多人住院，兩百四十五人死亡，對於醫療容量及社會經濟的影響甚鉅。
因事態嚴重，全球都在密切注意，我國安機制也早已啟動，海岸巡「晴空專案」持續，與此不無關連。因兩馬小三通，兩地交流頻繁及往返密切，加上走私貨品，而引起高度關切。
面對來勢洶洶的流感大流行，成立流感防治因應小組，並設置連江縣流感疫情應變中心，以三大策略、四道防線，期使本縣平安地渡過各類疫情風暴。
三大策略將以「流感疫苗」、「抗病毒藥物」、「傳染阻絕手段」三大主軸展開。四道防線則包括第一道防線「決戰境外」，進行國際合作，將疫情防堵於國外；第二道防線「邊境檢疫」，於入境機場、港口執行入境篩檢；第三道防線「社區防治」，建立社區防治共識及人力，以及適當的隔離策略；第四道防線「保全醫療體系」，建立感染症防治醫療網，計畫性收治病患。
不容諱言，大陸是疫情高危險區，金馬近在咫尺，小三通互動，危險性高於其他縣市，所以，在防範措施、疫情監測工作需高度加強。
第一，走私輸入防堵：禽流感是由禽畜之流行，再傳給人，而禽畜輸入及走私是爆發禽流感的元兇，除加強動物、肉品走私查緝之外，也呼籲宣導業者，千千萬萬不要攜進家禽及肉品。
第二，發燒篩檢：在出入小三通或兩岸間往返，在入境過濾及健康監測、自主管理上要全面強化，才能在未來防疫工作立於不敗之地。
第三，減少前往疫區：不是說不能去大陸，而是到大陸不要到疫情區域，在飲食及出入場所要加以注意，以保自己健康，也保地方的安全。
毋恃「流感」之不來，恃吾有以待之，現代疫情，等於大作戰，不可鬆懈，只要我們有防備，就不用怕；你認為它會來，它不一定會來，你認為它不會發生，它說不定會發生，我們防範得當，它就無法入侵。
毋恃流感之不來 恃吾有以待之
- 2005-09-24
